让口袋妖怪学习新技能的核心机制包括升级自学、技能机器（TM/HM）、教学招式（Move Tutor）以及进化继承。升级自学是最基础的方式，每只口袋妖怪在达到特定等级时会自动领悟对应技能，例如小火龙在16级可学会火焰喷射。技能机器分为一次性使用的TM和可重复使用的HM，需在背包中直接对目标口袋妖怪使用，如TM38（大字爆炎）可让火系精灵掌握强力火属性技能。教学招式则需寻找特定NPC支付游戏币或完成条件后学习，例如浅红市某NPC可教授报恩等实用技能。
通过合理规划技能组合，可以显著提升战斗效率。技能机器和教学招式的获取通常需要探索隐藏区域或完成支线任务，例如击败特定道馆馆主后获得的TM通常与其专精属性相关。部分技能如HM05（闪光）需推进主线至紫苑镇剧情后才能取得，这类技能虽无法在战斗中直接造成伤害，但能解锁新的地图区域。技能机器一旦使用便无法遗忘，需谨慎选择学习对象；而教学招式虽可重复学习，但消耗的资源较多。
位于浅红市的遗忘爷爷之家可免费让口袋妖怪遗忘已学会的技能，包括HM技能。这一功能对于调整战术组合尤为重要，例如将早期学习的低威力技能替换为后期获得的高阶技能。某些特殊技能如居合斩在通关过程中必须保留，建议优先让工具型口袋妖怪学习HM技能以避免占用主力输出精灵的技能栏位。
红莲岛研究所可通过化石复活获得具备独特技能的古代口袋妖怪，如菊石兽自带原始之力。通信进化产生的技能变化也属于隐藏机制，例如勇吉拉进化为胡地时会自动领悟精神强念。游戏后期在七岛区域还能发现教授终极技能的教学NPC，这些技能通常具有高威力或特殊效果，但需要完成特定挑战才能解锁教学资格。
技能属性相克是构建技能组合的基础准则。火系技能对草系效果显著但会被水系抵抗，这种属性关联直接影响技能选择优先级。建议通过图鉴系统查阅每只口袋妖怪可学习的全部技能列表，并参考属性克制表进行搭配。部分技能如破坏光线虽威力极高但存在使用后僵直的副作用，这类技能更适合在关键时刻使用而非常规战术配置。
